Sam Fisher : Ancien agent de la cellule secrète Echelon 3 de la NSA (National Security Agency). Il est à la recherche de la vérité sur la mort de sa fille. Il s'agit du personnage joué durant le mode solo.
Victor Coste : Meilleur ami de Sam Fisher. Ils se sont tous deux rencontrés lorsqu'ils étaient dans les Navy SEAL. Ce personnage semble aider l'ex-agent dans sa quête durant cet épisode de la série.
Anna Grmsdottir : Ancienne experte de la cellule, elle est devenue conseillère technique en chef. On ne sait pas trop quelle rôle elle va jouer, car elle semble à la fois aider Sam mais certaines vidéos et informations semblent infirmer cette théorie.
Tom Reed : C'est le nouveau chef d'Echelon 3. Il remplace donc Irving Lambert à ce poste.
Daniel Sloane-Suarez (alias Archer) : Agent de terrain de la cellule. Il s'était tout d'abord lancé dans une carrière d'analyste à la NSA. Mais, lassé de l'aspect bureaucratique de son travail et après 18 mois d'entraînement, il rejoint l'équipe d'Echelon 3.
Mikhail Volkov (alias Kestrel) : Agent de terrain de l'homologue russe d'Echelon 3, Voron.